Прочитать /usr/src/UPDATING
Шаги, которые нужно сделать вручную, описаны
в этом файле.

Исходный код располагается в /usr/src
Предпочитаемый метод обновления это с помощью git
Проверить:

cd /usr/src
git remote --v

Обновить исходники

git pull /usr/src

Если вы получили исходный код FreeBSD другим способом:

mv /usr/src /usr/src.bak 
git clone --branch releng/13.2 https://git.FreeBSD.org/src.git /usr/src